MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM298

Total Repeats: 3863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021882	C	6	6	28	33	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_021882	TGG	2	6	51	56	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021882	AAT	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021882	CTG	2	6	135	140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021882	AG	3	6	157	162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021882	ACC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021882	A	6	6	232	237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021882	CAAAA	2	10	264	273	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021882	A	6	6	270	275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021882	CAGAGC	2	12	312	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021882	TTC	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021882	TGAA	2	8	422	429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021882	TCA	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021882	A	6	6	575	580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021882	TCTT	2	8	584	591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021882	CATTCC	2	12	616	627	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021882	TAC	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021882	CTC	2	6	655	660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021882	CTAA	2	8	714	721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021882	TTTAG	2	10	811	820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021882	ATTT	2	8	967	974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021882	T	7	7	972	978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021882	CAC	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021882	T	7	7	1023	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021882	TCA	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021882	TTTC	2	8	1063	1070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021882	CTG	2	6	1182	1187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021882	CTC	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021882	ACC	2	6	1246	1251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021882	ACA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021882	AAT	2	6	1331	1336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021882	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021882	CCA	2	6	1453	1458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_021882	TC	3	6	1472	1477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021882	ATC	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021882	C	6	6	1700	1705	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_021882	AGT	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021882	TCA	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021882	CT	3	6	1810	1815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021882	TCT	2	6	1865	1870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021882	CAC	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021882	TTC	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021882	TA	3	6	2497	2502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021882	T	6	6	2535	2540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021882	TAA	2	6	2554	2559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021882	CGCAT	2	10	2637	2646	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_021882	ACGG	2	8	2663	2670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021882	GAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021882	AAAT	2	8	2841	2848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021882	C	7	7	2893	2899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_021882	ATT	3	9	3058	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021882	T	8	8	3076	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021882	TAA	2	6	3163	3168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021882	ATA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021882	AAT	2	6	3324	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021882	AAT	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021882	TAG	2	6	3483	3488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021882	A	7	7	3535	3541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021882	TTG	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021882	CAT	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021882	A	6	6	3815	3820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021882	TAC	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021882	AC	3	6	3929	3934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021882	A	7	7	3940	3946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021882	AAAATA	2	12	3967	3978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021882	TC	3	6	4043	4048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021882	ATG	2	6	4060	4065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021882	TGA	2	6	4082	4087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021882	AG	3	6	4094	4099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021882	A	6	6	4146	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021882	TTC	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021882	TTC	2	6	4185	4190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021882	TAG	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021882	T	6	6	4895	4900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021882	T	6	6	5837	5842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021882	T	6	6	5858	5863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021882	AT	3	6	6995	7000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021882	GAA	2	6	7017	7022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021882	ATA	2	6	7064	7069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021882	A	6	6	7956	7961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021882	T	6	6	10588	10593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021882	TAT	2	6	11803	11808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021882	TAC	2	6	12188	12193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021882	TAA	2	6	12667	12672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021882	A	6	6	13376	13381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021882	TAT	2	6	15158	15163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021882	T	6	6	26929	26934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021882	TAT	2	6	26959	26964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021882	ATTTTA	2	12	26971	26982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021882	CTA	2	6	26988	26993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021882	A	6	6	27016	27021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021882	A	13	13	30001	30013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021882	TC	3	6	31884	31889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021882	T	6	6	31909	31914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021882	T	6	6	33629	33634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021882	AT	3	6	33638	33643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021882	AGA	2	6	33653	33658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021882	TAAGG	2	10	33770	33779	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021882	CCA	2	6	33801	33806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021882	T	6	6	33975	33980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021882	ATTTT	2	10	33997	34006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021882	T	8	8	34003	34010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021882	T	6	6	34012	34017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021882	ATT	2	6	34023	34028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021882	AAAATC	2	12	34062	34073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_021882	GGT	2	6	39670	39675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021882	T	7	7	40249	40255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021882	TAA	2	6	40504	40509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021882	TAT	2	6	40530	40535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021882	A	6	6	40568	40573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021882	ATA	2	6	40605	40610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021882	T	6	6	40641	40646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021882	ACA	2	6	40660	40665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021882	T	9	9	42262	42270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021882	TTA	2	6	42297	42302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021882	ATG	2	6	50513	50518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021882	CA	3	6	50551	50556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021882	TTA	2	6	50574	50579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021882	A	6	6	50601	50606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021882	GGGGGC	2	12	60240	60251	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021882	TAAA	2	8	60271	60278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021882	TGG	2	6	60283	60288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021882	GTA	2	6	60446	60451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021882	A	6	6	60451	60456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021882	ATAA	2	8	60468	60475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021882	TAGG	2	8	60487	60494	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021882	TTTA	2	8	60651	60658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021882	T	7	7	60664	60670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021882	CAAA	2	8	60671	60678	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_021882	A	7	7	60698	60704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021882	AAT	2	6	60793	60798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021882	TTG	2	6	60800	60805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021882	TTA	2	6	60818	60823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021882	TCT	2	6	60845	60850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021882	AAT	2	6	60904	60909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021882	T	6	6	60971	60976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021882	ATG	2	6	61077	61082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021882	GTA	2	6	61095	61100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021882	A	6	6	61100	61105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021882	GATA	2	8	61144	61151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021882	A	6	6	61205	61210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021882	AAGA	2	8	61234	61241	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021882	TCA	3	9	61276	61284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021882	CTA	2	6	61691	61696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021882	GTA	2	6	63758	63763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021882	TTTAA	2	10	64760	64769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021882	A	6	6	68139	68144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021882	T	6	6	69520	69525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021882	ATT	2	6	69526	69531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021882	TCAA	2	8	70087	70094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021882	A	6	6	70193	70198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021882	G	6	6	72464	72469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021882	A	6	6	75378	75383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021882	AG	4	8	75403	75410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021882	TGA	2	6	75446	75451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_021882	T	11	11	78879	78889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_021882	A	6	6	81013	81018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021882	T	6	6	81626	81631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_021882	ACC	2	6	87931	87936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_021882	AAT	2	6	88522	88527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021882	TAA	2	6	88544	88549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021882	ACT	2	6	88550	88555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_021882	A	6	6	91081	91086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_021882	TA	3	6	143047	143052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_021882	ATA	2	6	184778	184783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_021882	ATTG	2	8	188898	188905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_021882	AAT	2	6	189787	189792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_021882	TAT	2	6	190866	190871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021882	ATT	2	6	190879	190884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_021882	TCT	2	6	193728	193733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_021882	ATT	2	6	193817	193822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_021882	ACC	2	6	193880	193885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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